1952: Del 9 de diciembre al 6 de enero el Padre Miguel de Huarte hace una visita de inspección al cantón Aguarico.
1953: El 22 de enero el Padre Miguel de Huarte presenta un informe de su visita.
1953: 16 de noviembre: creación de la Prefectura por Pío XII con la constitución Apostólica “Ex quo tempore”, del 16 de noviembre.
1954: 30 de abril: la Congregación de Propaganda Fide nombra primer Prefecto Apostólico de Aguarico a Mons. Higinio Gamboa.
1954: 20 de mayo. El Ministro general de la Orden Capuchina nombra Superior Regular de los capuchinos de Aguarico al P. Miguel de Arruazu (Higinio Gamboa)
1954: 18 de julio. El nuevo Prefecto Apostólico recibe la investidura canónica en el convento de Capuchinos de Ibarra de manos del Nuncio Apostólico Opilio Rossi.
1954: Entran los 5 primeros misioneros: Miguel de Arruazu, Camilo de Torrano, Miguel de Huarte, Ángel de Ucar y Antonio de Alsasua.
1954: P. Ricardo de Lizaso, Ministro Provincial de Navarra, de visita en Ecuador, se reúne con los superiores de la Misión en Quito.
1954: 15 de agosto en Nuevo Rocafuerte, el mismo Nuncio Opilio Rossi ejecuta la erección de la Prefectura Apostólica y da posesión de ella al Padre Higinio Gamboa.
1955: La Prefectura Apostólica de Aguarico firma un contrato con el Gobierno de Ecuador, firmado por el presidente de la República, José María Velasco Ibarra y Mons. Higinio Gamboa. Duración: diez años.
1955: Llegan dos nuevos misioneros: el Padre Eduardo Noáin y el Hno. Pastor Ibáñez.
1957: 26 de diciembre: Entra en la Misión, como Superior Regular, el P. Manuel de Beizama, nombrado por el Ministro General de la Orden Capuchina.
1957: 19 de febrero: El Padre Manuel recibe un cable de Roma, anunciándole que se revoca su nombramiento.
1958: El P. Jesús Langarica es nombrado Superior Regular de los Capuchinos de Aguarico.
1958: Ingresan los nuevos Misioneros: el P. Bernabé Villanueva, el Hno. Mariano de Azqueta y el Hno. Gregorio de la Almunia.
1958: El Padre Camilo de Torrano funda la segunda residencia de la Misión en Coca.
1959: Un nuevo misionero llega de España: el Padre Anastasio de Buñuel (Luis González)
1959: Se funda la residencia de Cuyabeno.
1960: Llegan de Argentina dos nuevos misioneros Capuchinos: el Padre Agustín de Vega y el Padre Arnoldo de BB. Aires.
1960: El Padre Camilo de Torrano funda la residencia de Pañacocha.
1961: Llegan los nuevos misioneros: el Hno. Felipe Garde y el Padre José Martín Irure.
1961: Los Capuchinos Argentinos fundan la residencia de Pompeya.
1961: El Padre Florencio de Artabia, Ministro Provincial de Navarra, visita la Misión de Aguarico.
1961: Son nombrados los nuevos Superiores de la Misión: Camilo Múgica, Superior Regular; Agustín de Vega y Miguel de Huarte, Consejeros.
1962: El Padre Arnoldo funda la residencia de Puerto Quinche.
1962: Llega a la Misión el nuevo misionero Alejo de Vidania (Juan Otaegui)
1964: 5 de febrero: Mons. Higinio Gamboa presenta ante el Prefecto de Propaganda Fide la renuncia a su cargo.
1965: 1 de febrero: el Nuncio en Ecuador Mons. Alfredo Bruñera comunica el nombramiento de Alejandro Labaka como nuevo Prefecto Apostólico.
1965: El Nuncio en Ecuador, Mons. Alfredo Bruniera, llama a la Nunciatura a Alejandro Labaka y al Procurador de la Misión P. Feliciano Noain, para pedirles que los Capuchinos se hagan cargo de los Aucas.
1965: 28 de marzo: Toma de posesión de Mons. Alejandro Labaka, en Coca.
1965: Llega a la Misión el P. Juan Santos Ortiz de Villalba.
1965: Mons. Alejandro Labaka participa en el Concilio Vaticano II hasta su clausura el 8 de diciembre.
1966: Es nombrado superior de los capuchinos del Ecuador el Padre Jesús Langarica.
1966: Por disposición del Ministro General se unen la Custodia de Ecuador y la Misión de Aguarico.
1967: Llegan nuevos misioneros: el Hno. Juan Astráin, el Hno. Nicolás Equiza, el P. Félix Blasco, el P. Ángel González, y el P. Néstor Zubeldía.
1967: El Padre Francisco de Arizcun, Ministro Provincial de Navarra, visita la Misión.
1968: Llega el nuevo misionero: el P. José Luis Muniáin.
1969: 20-30 de marzo: El Padre Clementito de Vlissingen, Ministro General de la Orden Capuchina, visita la Misión.
1969: Llega a la Misión el Padre Juan Enrique Marco.
1969: 22 de diciembre: el Definitorio general de la Orden Capuchina decreta la separación entre Viceprovincia y Custodia de Aguarico.
1969: 8 de febrero: Mons. Alejandro Labaka presenta su renuncia a Prefecto Apostólico.
1970: Llega a la Misión una numerosa expedición formada por el Hno. Pedro Elizalde, el P. Manuel Amunárriz y el P. Miguel Ángel Azcona.
1970: 11 de junio: Es nombrado Prefecto Apostólico Mons. Jesús Langarica
1970: La Orden Capuchina reorganiza sus estructuras: la Misión pasa a ser Custodia.
1970: Es nombrado primer Custodio el P. José Luis Muniáin. Primer capítulo.
1970: El Padre Aurelio Laita, Ministro Provincial de Navarra, visita la Misión.
1971: El Definidor general, el P. Clovis Frainer visita la Misión de Aguarico.
1971: El P. Lázaro Iriarte, Definidor general, pasa unos días con los misioneros, en plan de animación franciscana.
1972: Llegan a la Misión los Padres Francisco Escudero, Serafín Elizondo y José Miguel Goldáraz.
1973: Es elegido Custodio el P. Manuel Amunárriz. Segundo capítulo de la Custodia, presidido por el P. Aurelio Laita, Ministro Provincial.
1973: Fundación de la residencia de Enokanke.
1973: 27 de octubre-11 de noviembre: El Definidor general, el P. Clovis Frainer visita la Custodia.
1975: Llega a la Misión el Padre Amado Musitu.
1976: En el capítulo electivo es reelegido como Custodio el P. Manuel Amunárriz. Tercer capítulo.
1976: Llega a la Misión el P. Antonio Balenciaga.
1976: Navidad: Encarnación de Alejandro en el grupo Huaorani.
1977: El P. Juan Miguel Mendía, Ministro Provincial, visita oficialmente la Custodia.
1977: Es encargado de los Huaorani el P. Alejandro Labaka.
1978: Llega a la Misión el P. José María Sádaba.
1979: El Definidor general, el P. José Carlos Correa Pedroso, realiza la vista oficial.
1979: El P. Rufino Grández, Ministro Provincial, da los ejercicios espirituales a los Misioneros.
1979: Cuarto capítulo electivo de la Custodia, presidido por el P. Rufino Grández. Elegido Superior Regular, el P. Alejandro Labaka.
1980: Llega a la Misión el P. Juan Pedro Bonvin.
1981: El P. Roque Grández llega a la Misión.
1982: Quinto capítulo de la Custodia: reeligen como Custodio al P. Alejandro Labaka.
1982: Llega a la Misión el Hno. Paulino Villanueva.
1983: En visita oficial el Ministro Provincial Rufino Grández.
1984: Fundación de la nueva residencia de Shushufindi.
1984: 2 de julio: Bula “Aud ignoramus” de Juan Pablo II, por la que instituye el Vicariato Apostólico de Aguarico.
1984: 2 de julio: Nombramiento del Padre Alejandro Labaka como Obispo-Vicario de Aguarico.
1984: 9 de diciembre: Ordenación Episcopal de Mons. Alejandro Labaka en la catedral de Coca.
1984: Llegan los nuevos misioneros: el P. Alain Sermier, el P. Pedro José Irure, el P. Miguel Ángel Cabodevilla.
1984: Asamblea general del Vicariato: Proyecto Apostólico.
1985: Quinto capítulo de la Custodia: elegido Custodio el P. José Miguel Goldáraz.
1985: Visita la Custodia el Ministro Provincial de Navarra, Eleuterio Ruiz.
1986: Se funda la nueva presencia de Guayacán, por el P. Juan Pedro Bonvin.
1986: Carta de los Obispos de la Amazonía sobre tenencia de tierras.
1987: 21 de julio: muerte “martirial” de Mons. Alejandro Labaka y la Hna. Inés Arango.
1987: Nuevo misionero: llega a la Misión el P. Juan Carlos Andueza.
1987: Bodas de oro sacerdotales del P. Miguel Gamboa, antiguo Prefecto Apostólico.
1988: Llega a la misión el Hno. Luis Javier Carlos Garralda.
1988: Sexto capítulo de la Custodia: es reelegido el P. Pedro José Irure.
1989: El Ministro provincial de Navarra, el P. Eleuterio Ruiz visita la Custodia. Hay reunión de los Consejos de Viceprovincia y Custodia con P. Eleuterio.
1990: 21 de febrero: Es nombrado Obispo de Aguarico, el P. Jesús Esteban Sádaba.
1990: 3 de abril: Ordenación Episcopal de Mons. Jesús Esteban Sádaba en Pamplona.
1990: Mayo: Llega a la Misión el nuevo Obispo.
1991: El Ministro Provincial de Navarra, el P. Miguel Mª Andueza visita la Custodia.
1991: Séptimo capítulo de La Custodia: es reelegido el P. Pedro José Irure.
1992: Visita la Custodia el Definidor general, el P. Jerónimo Bórmida.
1992: Asamblea conjunta: Misión-Viceprovincia Capuchina de Ecuador. Se trata el tema de posible unión Custodia-Viceprovincia.
1992: Visita del Definidor general: el P. Andrés Stanovnik.
1992: Fallece el gran misionero de Aguarico: el P. Camilo Múgica.
1994: Octavo capítulo de Custodia: es elegido Custodio el P. Juan Carlos Andueza.
1994: Visita la Custodia el Min. Provincial Miguel Mª Andueza, que preside el Capítulo.
1995: Visita la Viceprovincia y Custodia el Definidor general: el P. Andrés Sanovnik.
1996: Asamblea conjunta: Preside el P. Andrés Stanovnik. Se trata el tema de la unión Custodia-Viceprovincia.
1996: Llega a la Misión el hermano colombiano P. Alfonso Miranda.
1997: 1 de enero: Decreto uniendo a todos los Capuchinos de Ecuador en única Viceprovincia.
1997: Capítulo de Viceprovincia: preside el P. Jhon Corriveau, Ministro general. Asisten Mons. Jesús Esteban Sádaba, Obispo-Vicario de Aguarico, el P. Eleuterio Ruiz, Ministro Provincial de Navarra y el P. Andrés Stanovnik, Definidor general.
1997: El Hno. Antonio Espinosa, nuevo misionero
1998: Llegan nuevos misioneros ecuatorianos: P. José Briones, Hno. Leonardo Guaya, Hno. Galo Flor.
1999: Visita la Misión el Definidor general Padre Andrés Stanovnik.
1999: Se deja la presencia de Shushufindi, asumida por los Conventuales.
2000: Llega a la Misión el Hno. Dick Ramírez.
2001: 22 enero: erección canónica del Monasterio de Clarisas capuchinas en Coca.
2001: El capuchino argentino P. Pedro Lepphaille llega a la Misión
2002: Llegan a la Misión: Hno. Ángel Mª Vizcay, Hno. Leonardo Luna, Hno. Freddy Sarango, P. José Antonio Recalde.
2002: El P. José Casañas, uruguayo, exprovincial de Provincia del Río de la Plata, llega a la Misión para un año sabático.
2002: Noviembre: Visita la Misión el P. Benjamín Echeverría, Ministro provincial de Navarra.
2002: 26 noviembre: Solemne inauguración del Monasterio de Clarisas.
2003: Octubre: Llega a la Misión el P. Gonzalo Maldonado.
2003: Del 17 de octubre al 7 de noviembre: Visita de nuestro hermano definidor para América Latina: Manoel Delson Pedreira da Cruz
2003: 3-7 de noviembre: asamblea de capuchinos en Coca, con presencia del Ministro general Hno. John Corriveau, el hermano Definidor General y el Ministro Provincial, para celebrar los 50 años de la misión capuchina.